Братская могила 200 участников обороны Севастополя, погибших в июне 1942

Во внутреннем дворе Храма находится «Братская могила двухсот участников обороны Севастополя, погибших в июне 1942 г.от налетов вражеской авиации и артобстрела. Вечная память павшим за нашу Советскую Родину!»

Во время Второй Мировой войны здание собора сильно пострадало от бомбежек. Южный придел (правое крыло здания) был разрушен прямым попаданием авиабомбы. По свидетельству старожилов Севастополя, во время обороны 1941-1942 гг. жители города прятались в храме от обстрелов и налетов авиации.

После освобождения Севастополя в 1944 г. руины города, все здания обследовали саперы. Несколько десятилетий на восточном фасаде храма, выходящем на ул. Большую Морскую, было написано: «Проверено. Мин нет. Ильин. 12 мая 1944 года». Во время ремонта здания надпись заштукатурили.